Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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