Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TP20293 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TP20293 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TP20293 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TP20293 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TP20293 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TP20293 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TP20293 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TP20293 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TP20293 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TP20293 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TP20293 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TP20293 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TP20293 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TP20293 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TP20293 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TP20293 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TP20293 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TP20293 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TP20293 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TP20293 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TP20293 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TP20293 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TP20293 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TP20293 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TP20293 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TP20293 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TP20293 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TP20293 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TP20293 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TP20293 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TP20293 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TP20293 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TP20293 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TP20293 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TP20293 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TP20293 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TP20293 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TP20293 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TP20293 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TP20293 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TP20293 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TP20293 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TP20293 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TP20293 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TP20293 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TP20293 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TP20293 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TP20293 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TP20293 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TP20293 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TP20293 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TP20293 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TP20293 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TP20293 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TP20293 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TP20293 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TP20293 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TP20293 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TP20293 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TP20293 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TP20293 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TP20293 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TP20293 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TP20293 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TP20293 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TP20293 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TP20293 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TP20293 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TP20293 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TP20293 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TP20293 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TP20293 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TP20293 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TP20293 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TP20293 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TP20293 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TP20293 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TP20293 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TP20293 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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