Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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