Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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DmdP11531 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DmdP11531 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DmdP11531 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DmdP11531 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DmdP11531 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DmdP11531 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DmdP11531 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DmdP11531 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
DmdP11531 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
DmdP11531 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
DmdP11531 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
DmdP11531 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DmdP11531 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DmdP11531 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DmdP11531 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DmdP11531 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DmdP11531 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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DmdP11531 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DmdP11531 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DmdP11531 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DmdP11531 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DmdP11531 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DmdP11531 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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DmdP11531 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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DmdP11531 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DmdP11531 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DmdP11531 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DmdP11531 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DmdP11531 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DmdP11531 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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DmdP11531 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DmdP11531 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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DmdP11531 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DmdP11531 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DmdP11531 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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DmdP11531 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DmdP11531 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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DmdP11531 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DmdP11531 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DmdP11531 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DmdP11531 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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DmdP11531 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DmdP11531 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DmdP11531 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DmdP11531 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DmdP11531 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DmdP11531 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DmdP11531 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DmdP11531 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DmdP11531 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DmdP11531 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DmdP11531 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DmdP11531 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DmdP11531 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DmdP11531 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DmdP11531 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DmdP11531 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DmdP11531 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DmdP11531 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DmdP11531 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms