Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P10404 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P10404 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P10404 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P10404 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P10404 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
P10404 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
P10404 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
P10404 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
P10404 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P10404 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P10404 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P10404 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P10404 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
P10404 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P10404 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P10404 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P10404 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P10404 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P10404 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
P10404 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P10404 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P10404 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P10404 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P10404 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P10404 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P10404 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P10404 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P10404 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P10404 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P10404 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P10404 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P10404 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
P10404 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P10404 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
P10404 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
P10404 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P10404 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
P10404 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
P10404 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P10404 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P10404 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P10404 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P10404 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P10404 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
P10404 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P10404 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P10404 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P10404 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
P10404 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P10404 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
P10404 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
P10404 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
P10404 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P10404 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
P10404 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
P10404 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
P10404 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
P10404 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
P10404 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
P10404 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
P10404 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
P10404 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P10404 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
P10404 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
P10404 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
P10404 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
P10404 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P10404 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P10404 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P10404 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P10404 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
P10404 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P10404 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P10404 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
P10404 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
P10404 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
P10404 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
P10404 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
P10404 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
P10404 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
P10404 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
P10404 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
P10404 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
P10404 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
P10404 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
P10404 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
P10404 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
P10404 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
P10404 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
P10404 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
P10404 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
P10404 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
P10404 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
P10404 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
P10404 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
P10404 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
P10404 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
P10404 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
P10404 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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