Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

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Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spta1P08032 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spta1P08032 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spta1P08032 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Spta1P08032 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spta1P08032 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spta1P08032 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spta1P08032 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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