Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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H2-Eb1P04230 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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H2-Eb1P04230 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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H2-Eb1P04230 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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H2-Eb1P04230 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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H2-Eb1P04230 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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H2-Eb1P04230 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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H2-Eb1P04230 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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H2-Eb1P04230 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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H2-Eb1P04230 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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