Protein–RNA interactions for Protein: P01739

T-cell receptor alpha chain V region 2B4, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01739 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01739 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01739 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01739 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01739 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01739 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01739 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01739 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01739 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01739 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01739 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01739 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01739 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01739 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01739 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01739 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01739 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01739 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01739 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01739 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01739 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01739 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01739 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01739 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01739 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01739 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms