Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Mtatp6P00848 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms