Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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