Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Itgb3O54890 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Itgb3O54890 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Itgb3O54890 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Itgb3O54890 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Itgb3O54890 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Itgb3O54890 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Itgb3O54890 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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