Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TsksO54887 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TsksO54887 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TsksO54887 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TsksO54887 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TsksO54887 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TsksO54887 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TsksO54887 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TsksO54887 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TsksO54887 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TsksO54887 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TsksO54887 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TsksO54887 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TsksO54887 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TsksO54887 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TsksO54887 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TsksO54887 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TsksO54887 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TsksO54887 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TsksO54887 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TsksO54887 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TsksO54887 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TsksO54887 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TsksO54887 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TsksO54887 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TsksO54887 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TsksO54887 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TsksO54887 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TsksO54887 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TsksO54887 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TsksO54887 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TsksO54887 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TsksO54887 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TsksO54887 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TsksO54887 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TsksO54887 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TsksO54887 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TsksO54887 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TsksO54887 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TsksO54887 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TsksO54887 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TsksO54887 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TsksO54887 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TsksO54887 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TsksO54887 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TsksO54887 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TsksO54887 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TsksO54887 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TsksO54887 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TsksO54887 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TsksO54887 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TsksO54887 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TsksO54887 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TsksO54887 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TsksO54887 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TsksO54887 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TsksO54887 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TsksO54887 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TsksO54887 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TsksO54887 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TsksO54887 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TsksO54887 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TsksO54887 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TsksO54887 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TsksO54887 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TsksO54887 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TsksO54887 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TsksO54887 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TsksO54887 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TsksO54887 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TsksO54887 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TsksO54887 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TsksO54887 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TsksO54887 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TsksO54887 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TsksO54887 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TsksO54887 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TsksO54887 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TsksO54887 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TsksO54887 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TsksO54887 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TsksO54887 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TsksO54887 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TsksO54887 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TsksO54887 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TsksO54887 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TsksO54887 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TsksO54887 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TsksO54887 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TsksO54887 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TsksO54887 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TsksO54887 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TsksO54887 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TsksO54887 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TsksO54887 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TsksO54887 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TsksO54887 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TsksO54887 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TsksO54887 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TsksO54887 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.4 ms