Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab33bO35963 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms