Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FxnO35943 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FxnO35943 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FxnO35943 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FxnO35943 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FxnO35943 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FxnO35943 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FxnO35943 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FxnO35943 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FxnO35943 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FxnO35943 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FxnO35943 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FxnO35943 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FxnO35943 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
FxnO35943 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FxnO35943 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FxnO35943 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FxnO35943 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FxnO35943 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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FxnO35943 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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FxnO35943 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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FxnO35943 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FxnO35943 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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FxnO35943 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FxnO35943 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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FxnO35943 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FxnO35943 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FxnO35943 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FxnO35943 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FxnO35943 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FxnO35943 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FxnO35943 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FxnO35943 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FxnO35943 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FxnO35943 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FxnO35943 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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FxnO35943 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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FxnO35943 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FxnO35943 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FxnO35943 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FxnO35943 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FxnO35943 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FxnO35943 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FxnO35943 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FxnO35943 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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FxnO35943 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FxnO35943 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FxnO35943 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FxnO35943 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FxnO35943 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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FxnO35943 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FxnO35943 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FxnO35943 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FxnO35943 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FxnO35943 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FxnO35943 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FxnO35943 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FxnO35943 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FxnO35943 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FxnO35943 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FxnO35943 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FxnO35943 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FxnO35943 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FxnO35943 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FxnO35943 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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