Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Gm43040-201ENSMUST00000202399 558 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Olfr1091-ps1-201ENSMUST00000216676 595 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Mup17-201ENSMUST00000107484 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Gm43690-201ENSMUST00000201213 266 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 AC138284.2-201ENSMUST00000213982 567 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Lhx8O35652 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms