Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ebi3O35228 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ebi3O35228 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms