Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casq1O09165 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casq1O09165 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casq1O09165 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casq1O09165 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casq1O09165 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Casq1O09165 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casq1O09165 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casq1O09165 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casq1O09165 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Casq1O09165 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casq1O09165 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms