Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms