Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC1

Gm933, Predicted gene 933, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm933J3QPC1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm933J3QPC1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms