Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS9

E030018B13Rik, RIKEN cDNA E030018B13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E030018B13RikJ3QMS9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
E030018B13RikJ3QMS9 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms