Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gm3415J3QMS8 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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