Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Gm20828J3KMI7 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Gm20828J3KMI7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Gm20828J3KMI7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Gm20828J3KMI7 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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