Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI0

Gm20815, Predicted gene, 20815, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20815J3KMI0 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20815J3KMI0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms