Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Usp17lcG5E8I7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp17lcG5E8I7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp17lcG5E8I7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp17lcG5E8I7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Usp17lcG5E8I7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp17lcG5E8I7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp17lcG5E8I7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Usp17lcG5E8I7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Usp17lcG5E8I7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp17lcG5E8I7 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp17lcG5E8I7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp17lcG5E8I7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp17lcG5E8I7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp17lcG5E8I7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp17lcG5E8I7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Usp17lcG5E8I7 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp17lcG5E8I7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp17lcG5E8I7 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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Usp17lcG5E8I7 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Usp17lcG5E8I7 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Usp17lcG5E8I7 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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