Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sclt1G5E861 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms