Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ3

Usp32, Ubiquitin-specific peptidase 32, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp32F8VPZ3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp32F8VPZ3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp32F8VPZ3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms