Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms