Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms