Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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