Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
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Rdh16f1E9Q9P8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Rdh16f1E9Q9P8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Rdh16f1E9Q9P8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Rdh16f1E9Q9P8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Rdh16f1E9Q9P8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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