Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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Pdzd2E9Q1M1 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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