Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms