Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ttc17E9PVB5 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ttc17E9PVB5 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc17E9PVB5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc17E9PVB5 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc17E9PVB5 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc17E9PVB5 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Ttc17E9PVB5 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc17E9PVB5 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc17E9PVB5 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc17E9PVB5 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc17E9PVB5 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc17E9PVB5 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc17E9PVB5 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc17E9PVB5 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc17E9PVB5 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc17E9PVB5 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc17E9PVB5 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc17E9PVB5 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc17E9PVB5 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc17E9PVB5 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc17E9PVB5 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc17E9PVB5 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc17E9PVB5 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc17E9PVB5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc17E9PVB5 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc17E9PVB5 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc17E9PVB5 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc17E9PVB5 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc17E9PVB5 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc17E9PVB5 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc17E9PVB5 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc17E9PVB5 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc17E9PVB5 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc17E9PVB5 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc17E9PVB5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc17E9PVB5 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc17E9PVB5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms