Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms