Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc170D3YXL0 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc170D3YXL0 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc170D3YXL0 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc170D3YXL0 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc170D3YXL0 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc170D3YXL0 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms