Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rfx8D3YU81 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rfx8D3YU81 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rfx8D3YU81 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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