Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Phf11cB4XVP9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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