Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms