Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Grik3B1AS29 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Grik3B1AS29 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Grik3B1AS29 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Grik3B1AS29 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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