Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms