Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Prr16A3KMN5 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Prr16A3KMN5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Prr16A3KMN5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Prr16A3KMN5 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms