Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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