Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Syndig1A2ANU3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms