Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms