Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms