Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

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Length 543 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm27029A2A4P4 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm27029A2A4P4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm27029A2A4P4 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm27029A2A4P4 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm27029A2A4P4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm27029A2A4P4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm27029A2A4P4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm27029A2A4P4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm27029A2A4P4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm27029A2A4P4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm27029A2A4P4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm27029A2A4P4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm27029A2A4P4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm27029A2A4P4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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