Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Mrpl40Q9Z2Q5 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Mrpl40Q9Z2Q5 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Mrpl40Q9Z2Q5 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Mrpl40Q9Z2Q5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Mrpl40Q9Z2Q5 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Mrpl40Q9Z2Q5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Mrpl40Q9Z2Q5 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Mrpl40Q9Z2Q5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Mrpl40Q9Z2Q5 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Mrpl40Q9Z2Q5 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Mrpl40Q9Z2Q5 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Mrpl40Q9Z2Q5 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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