Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms