Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn7Q9Z261 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn7Q9Z261 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn7Q9Z261 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn7Q9Z261 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn7Q9Z261 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn7Q9Z261 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn7Q9Z261 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn7Q9Z261 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn7Q9Z261 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn7Q9Z261 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn7Q9Z261 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn7Q9Z261 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn7Q9Z261 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn7Q9Z261 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn7Q9Z261 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn7Q9Z261 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn7Q9Z261 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn7Q9Z261 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn7Q9Z261 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn7Q9Z261 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn7Q9Z261 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn7Q9Z261 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn7Q9Z261 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms