Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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